Selon les statuts de la Fondation Pierre Mercier pour la Science datant du 6 octobre 1999, les buts sont les suivants :
soutenir des projets scientifiques originaux, essentiellement en recherche fondamentale, appliquée ou clinique dans le domaine biomédical;
s'intéresser aux divers moyens de remédier au déséquilibre provoqué par l'industrialisation sur l'écologie et la santé.
La préférence sera donnée aux projets susceptibles d'aboutir à des applications à court ou moyen terme dans les domaines précités.
La Fondation est une institution de pure utilité publique, sans but lucratif.